4月19日,应我中心赵兴明教授的邀请,加拿大萨斯喀彻温大学(University of Saskatchewan)吴方向(Fangxiang Wu)教授在嘉定校区电信楼403室作了题为“Network Energy-based Methods for Disease GenePrediction”的学术报告。
报告会上,吴教授首先通过分析OMIM数据库中疾病和基因的数量不对称来引出问题:人体肯定还存在未知的疾病基因,如何利用机器学习来预测疾病相关基因。接下来,他系统性地介绍其在该领域的研究成果:利用玻尔兹曼分布来刻画基因-疾病网络的概率分布,运用模拟退火思想来寻找最优参数进而实现对未知疾病基因的预测。实验结果表明,他的方法不仅在精度上还是速度上都较已有算法有明显的提高。报告结束后,继续与师生就报告中涉及的问题展开了热烈讨论并与赵兴明教授讨论了具体的合作事宜。
吴方向(Fangxiang Wu)教授,于2004年获得加拿大萨斯喀彻温大学(University of Saskatchewan)生物信息学和系统生物学博士学位。目前是加拿大萨斯喀彻温大学生物医学工程系的全职教授,生物医学工程研究生院院长。主要研究方向包括生物信息学中机器学习方法的研究,生物大数据的分析,基于分子网络可控性和可观测性的复杂疾病的治疗和诊断研究,复杂网络的分析,非线性生物动力学分析。FangXiang Wu教授在相关期刊和会议发表了超过230篇的技术论文。
吴方向(Fangxiang Wu)教授是IEEE的Senior Member,多个国际知名期刊(Proteomics,BMC Systems Biology,Briefings inBioinformatics和Scientific Report等)的编委会成员和客座编辑,也是BIBM等多个国际会议的程序委员会主席。